يهدف نظام حماية البيانات الشخصية إلى حماية البيانات الشخصية بجميع أنواعها، وتشمل كل بيان مهما كان شكله ومصدره ويؤدي إلى معرفة الفرد على وجه التحديد، أو يجعل التعرف عليه ممكنا بصورة مباشرة أو غير مباشرة. ويمكن إيجاز أهداف النظام فيما يلي:
1- ضمان المحافظة على خصوصية أصحاب البيانات الشخصية.
2- تنظيم مشاركة البيانات الشخصية وتداولها بين الجهات المختصة بطريقة نظامية.
3- منع إساءة استعمال البيانات الشخصية والحد من الممارسات الخاطئة.